智能卡的种类非常多，如果按照存储方式来划分的话，主要由磁卡、IC卡、异型卡（比如说那种打孔的大学食堂饭卡，这种名称是我自己随便定义的）等。
在这几种卡理存储量最大的是 IC卡，磁卡和异形卡存储的数据都很少。异形卡一般只存储了用于标识自己的标识信息（序列号）；磁卡一般保存了标识信息、少量的附加信息（简单的帐号信息、以及校验信息）；IC卡保存了标识信息以外往往还有很多附加信息。目前，在国内使用得最广泛的智能卡系统就是磁卡，其次是 IC卡，而异型卡基本上只在特定的领域才有使用。
保密性
由于各种智能卡的主要用途是用来识别用户的身份，因此，对于智能卡而言，CIA 中的“保密性”必然是最重要的了。
由于异形卡保存的信息完全是编码后保存在卡片的物理结构中，其实这种原理类似于传统的钥匙。只要有人能够拿到这种异形卡的图像信息或者物理接触卡片，就可以完全复制卡片中存储的标识信息。如果缺乏其他的手段，异形卡的数据几乎无法保障数据的保密性，复制卡片将难以避免。
磁卡保存的信息是保存在卡片背面的磁条上的，由于现在的磁卡（主要是银行磁卡）基本上都满足 ISO7810系列标准的相关要求，因此只要以非常低廉的价格购买到读写设备，就能完全复制卡片中的所有数据。当然，以现在民间的技术，对磁卡的读写操作是必须物理接触的。因此，只要能物理访问到磁卡，磁卡的保密性就难以得到保障。如果缺乏其他的手段，磁卡中数据的保密性几乎无法保障，复制卡片将难以避免。（扩展阅读《磁卡的基础知识》、《中国建设银行储蓄卡卡号编码规则和磁条数据格式标准》）
而对于 IC卡而言，基本上可以分为接触式的 IC卡和非接触式的 IC卡两种。接触式的 IC卡大家见得最多的可能就是IC电话卡，非接触式的IC卡大家最常见的就是二代身份证和公交一卡通。IC卡中有一类是只存储了用于标识卡片的序列号，这类IC卡通常被成为 ID卡，而另外一类IC卡存储空间较大，而且能够实现一定的算法，通常被成为智能卡或 IC卡。例如充值类的 IC卡，比如电卡、IC电话卡都是接触式的智能IC卡，门禁卡一般是非接触式的 ID 卡，二代身份证和护照一般都是非接触式的IC卡。ID卡一般是只读卡片，卡内存储的数据只有一个由厂商写入的ID号，而